| Systém: | RNA |
| Komponenta: | RNA viru SARS-CoV-2 - emergentní varianta (sekvenace) |
| Druh veličiny: | Vlastnost / popis |
| Jednotka: | - |
| Procedura: | * |
| Klíč: | 50804 |
| NPU Code: |
| Gesce: | mikrobiologie |
| Vznik: | Měřené, odvozené nebo pozorované v laboratoři |
| Typ položky: | F |
| Formát ref. mezí: | bez referenčních mezí |
| Formát hodnoty: | formalizovaný text dle MTV -plný |
| Mezní hodnoty: |
| MTV: | GTYPCOV, X |
| Třída hlavní: | Nukleové kyseliny a deriváty |
| Pokyny, poznámky, info: |
| Položka s procedurou * bude použita jen výjimečně při předávání dat z jiných (zahraničních) IS - používejte přednostně položku s procedurou SEQ (NČLP 50805)! |
| Podklady pro preanalytickou fázi |
| Materiál: | |
| Odběr do: | |
|
Slouží k interpretaci sekvenačního vyšetření viru - uvádí se zjištěná varianta dle číselníku emergentních variant. Pokud je zjištěna varianta mimo rozsah číselníku, zadává se "jiná varianta". |
| Text abstraktu ke komponentě |
| Referenční meze |
| Viz též: |
| * |
| Vlastnost / popis |
| Systém: | RNA |
| Komponenta: | RNA viru SARS-CoV-2 - emergentní varianta (sekvenace) |
| Druh veličiny: | Vlastnost / popis |
| Jednotka: | - |
| Procedura: | SEQ |
| Klíč: | 50805 |
| NPU Code: |
| Gesce: | mikrobiologie |
| Vznik: | Měřené, odvozené nebo pozorované v laboratoři |
| Typ položky: | F |
| Formát ref. mezí: | bez referenčních mezí |
| Formát hodnoty: | formalizovaný text dle MTV -plný |
| Mezní hodnoty: |
| MTV: | GTYPCOV, X |
| Třída hlavní: | Nukleové kyseliny a deriváty |
| Pokyny, poznámky, info: |
|
Slouží ke sdělení (interpretaci) sekvenačního vyšetření viru - uvádí se zjištěná varianta dle číselníku sledovaných
variant GTYPCOV. Pokud je zjištěna varianta mimo rozsah číselníku, zadává se zde "jiná varianta" a v položce NČLP 50803
se uvádí kódem dle Pangolin lineage, případně v položce 51360 kódem WHO či Nextstrain. Ke sdělení vlastností zjištěné
varianty slouží položka 50910 (uvádí se volným textem). Číselník GTYPCOV je průběžně doplňován dle pokynů z NRL SZÚ a je provázný s maticí "SARS-CoV-2" NRL SZÚ. |
| Podklady pro preanalytickou fázi |
| Materiál: | |
| Odběr do: | |
|
Slouží k interpretaci sekvenačního vyšetření viru - uvádí se zjištěná varianta dle číselníku emergentních variant. Pokud je zjištěna varianta mimo rozsah číselníku, zadává se "jiná varianta" v položce NČLP 50803. |
| Text abstraktu ke komponentě |
| Referenční meze |
| Viz též: |
| Vlastnost / popis |