Přehled
současných vyšetření SARS CoV-2 v NČLP (k 17. 12.
2020):
Žlutě podbarvené klíče položek jsou novinky zavedené k 1. 12. 2020 (prosincový
upgrade NČLP).
Zeleně podbarvené klíče položek jsou novinky zavedené k 17. 12. 2020 (prosincový
upgrade NČLP).
A1.
„PCR vyšetření“ (detekce RNA)
19934 RNA viru SARS CoV-2 (SPCORL; přítomnost
[-] *)
19935 RNA viru SARS CoV-2 (SPCORL; přítomnost
[-] PCR)
50701 RNA viru SARS CoV-2 (SPCORL; přítomnost [-] LAMP)
50702 RNA viru SARS CoV-2 (SPCORL; přítomnost [-] PCRM)
19936 RNA viru SARS CoV-2 (SPCRESP; přítomnost
[-] *)
19937 RNA viru SARS CoV-2 (SPCRESP; přítomnost
[-] PCR)
50703 RNA viru SARS CoV-2 (SPCRESP; přítomnost [-] PCRM)
50375 RNA viru SARS CoV-2 (CSF; přítomnost [-]
*)
50376 RNA viru SARS CoV-2 (CSF; přítomnost [-]
PCR)
50698 RNA viru SARS CoV-2 (SAL; přítomnost [-] *)
50700 RNA viru SARS CoV-2 (SAL; přítomnost [-] PCR)
50699 RNA viru SARS CoV-2 (SAL; přítomnost [-] LAMP)
A2.
„PCRQ vyšetření“ (detekce RNA - kvantitativně)
50704 RNA viru
SARS CoV-2 (P; arb. látková konc. [kU/l] *)
50705 RNA viru SARS CoV-2
(P; arb. látková konc. [kU/l] PCRQ)
Upozornění:
Pro mikrobiologická vyšetření ze systémů SPCORL,
SPCRESP a CSF se uvádí upřesnění systému - tzv. „specifikace“ (viz DASTA,
datový blok ku_z_lab, atributy: syst_sp_klic a syst_sp_text a případně subsp_text).
Pro SPCORL
(horní cesty dýchací) to jsou specifikace: LANTH, LASIN, PUMEAR, PUSIN, SWEAR,
SWGIN, SWLAR (výtěr z laryngu),
SWMEAR, SWMOU, SWNAS (výtěr z nosu),
SWNTH (výtěr z nosohltanu), SWTHR (výtěr z hrdla), SWTON
(výtěr z tonsil).
Pro SPCRESP
(dolní cesty dýchací) jsou secifikace: ASBRO, ASTRA, BRBRC, ENDOTRAC, EXSOPNT (sputum vykašlané), EXINDUK (sputum indukované), LABRAL,
LABRALC, LABRO, LUNG(BI), PLF.
Pro CSF
(likvor) jsou specifikace: KOMORY, PATKANAL.
Pro SAL (sliny) nejsou
žádné další specifikace (systém je samostatný, není součástí SPCORL).
Položky s procedurou * jsou pouze pro
výjimečné situace, kdy nelze proceduru zjistit, používejte výjimečně!
Poznámky:
Pro vyšetření z běžných výtěrů pro vyšetření RNA
viru SARS CoV-2 slouží položka 19935.
Pokud IS dosud neumí pracovat se specifikacemi
mikrobiologických systémů, lze ji při sdělování (zejména do ÚZIS) provizorně
dočasně uvádět volným textem do položky 20898.
Procedura LAMP
je nově zavedena od prosincového upgrade 2020.
Procedura PCRQ
je nově zavedena od prosincového upgrade 2020 pro kvantitativní stanovení.
Procedura PCRM je zavedena jen
výjimečně pro vyšetření SARS CoV-2 na základě požadavků ÚZIS.
Běžně se PCRM
nerozlišuje, pracuje se pouze s PCR.
Podrobnější specifikaci
procedury lze vkládat do položky 20898 - viz popis níže v části „D“.
B.
„antigen“ (detekce antigenu)
19930 Antigen viru SARS CoV-2 (P; přítomnost [-]*)
50371 Antigen viru SARS CoV-2 (P; přítomnost [-]IA)
19931 Antigen viru SARS CoV-2 (P; přítomnost [-]ICHR)
19932 Antigen viru SARS CoV-2 (S; přítomnost [-]*)
50372 Antigen viru SARS CoV-2 (S; přítomnost [-]IA)
19933 Antigen viru SARS CoV-2 (S; přítomnost [-]ICHR)
50373 Antigen viru SARS CoV-2 (SPCORL; přítomnost [-]*)
50779
Antigen viru SARS CoV-2 (SPCORL; přítomnost [-]IA)
50374 Antigen viru SARS CoV-2 (SPCORL; přítomnost [-]ICHR) - rychlotest z výtěru z oblasti „ORL“
50696 Antigen viru SARS
CoV-2 (SAL; přítomnost [-]*)
50778
Antigen viru SARS CoV-2 (SAL; přítomnost [-] IA)
50697 Antigen viru SARS
CoV-2 (SAL; přítomnost [-]ICHR) -
rychlotest ze slin
Upozornění:
Pro mikrobiologická vyšetření ze systému SPCORL se
uvádí upřesnění systému - tzv. „specifikace“ (viz DASTA, datový blok ku_z_lab, atributy: syst_sp_klic a syst_sp_text
a případně subsp_text).
Pro SPCORL
(horní cesty dýchací) to jsou specifikace: LANTH, LASIN, PUMEAR, PUSIN, SWEAR,
SWGIN, SWLAR (výtěr z laryngu), SWMEAR, SWMOU, SWNAS (výtěr z nosu),
SWNTH (výtěr z nosohltanu), SWTHR (výtěr z hrdla), SWTON (výtěr z tonsil).
Systém SAL (sliny) je k dispozici samostatně, není součástí SPCORL.
Stanovení procedurou IA (například CLIA, ELISA aj.), nebo ICHR
(rychlotest) jsou kvalitativně velmi odlišná, nutno rozlišovat! Stanovení
s procedurou * je předpřipraveno především pro případ nových jiných
vyšetření, která se objeví v mezidobí mezi upgrade NČLP. Položky s procedurou
* používejte jen výjimečně!
K proceduře IA
lze sdělovat upřesnění (specifikaci - např. CLIA, ELISA aj.), zasílá se v datovém bloku DASTA
ku_z_lab v atributu spec_proc.
C. „protilátky proti SARS
CoV-2“
U položek s druhem veličiny ARBC
(arb. konc.) jsou sdělované textové výsledky dle matice MTV = KVAL.
U položek s druhem veličiny RODIP
(relativní optická denzita) jsou
vždy sdělované textové výsledky dle matice MTV = KVAL a současně mohou být
zasílané naměřené hodnoty jako tzv. „index pozitivity“.
U položek s druhem veličiny ARBSC
(arbitrární látková koncentrace) jsou sdělované numerické výsledky
v jednotkách kU/l (kIU/l) společně s referenčními mezemi (škálami). Pro SARS CoV-2 dosud nejsou.
IgM:
50367 Anti-SARS CoV-2 IgM (B; arb. konc. [arb.j.] *)
50368 Anti-SARS CoV-2 IgM (B; arb. konc. [arb.j.] ICHR) - „rapid test“
19924 Anti-SARS CoV-2 IgM (P; arb. konc. [arb.j.] *)
19940 Anti-SARS CoV-2 IgM (P; arb. konc. [arb.j.] IA)
50369 Anti-SARS CoV-2 IgM (P; arb. konc. [arb.j.] ICHR)
19925 Anti-SARS CoV-2 IgM (S; arb. konc. [arb.j.] *)
19941 Anti-SARS CoV-2 IgM (S; arb. konc. [arb.j.] IA)
50370 Anti-SARS CoV-2 IgM (S; arb. konc. [arb.j.] ICHR)
50588
Anti-SARS CoV-2 IgM (P; rel. opt. denzita [-] *)
50589
Anti-SARS CoV-2 IgM (P; rel. opt. denzita [-] IA)
50590
Anti-SARS CoV-2 IgM (S; rel. opt. denzita [-] *)
50591
Anti-SARS CoV-2 IgM (S; rel. opt. denzita [-] IA)
IgG:
50363 Anti-SARS CoV-2 IgG (B; arb. konc. [arb.j.] *)
50364 Anti-SARS CoV-2 IgG (B; arb. konc. [arb.j.] ICHR) - „rapid test“
19922 Anti-SARS CoV-2 IgG (P; arb. konc. [arb.j.] *)
19938 Anti-SARS CoV-2 IgG (P; arb. konc. [arb.j.] IA)
50365 Anti-SARS CoV-2 IgG (P; arb. konc. [arb.j.] ICHR)
19923 Anti-SARS CoV-2 IgG (S; arb. konc. [arb.j.] *)
19939 Anti-SARS CoV-2 IgG (S; arb. konc. [arb.j.] IA)
50366 Anti-SARS CoV-2 IgG (S; arb. konc. [arb.j.] ICHR)
50584
Anti-SARS CoV-2 IgG (P; rel. opt. denzita [-] *)
50585
Anti-SARS CoV-2 IgG (P; rel. opt. denzita [-] IA)
50586
Anti-SARS CoV-2 IgG (S; rel. opt. denzita [-] *)
50587
Anti-SARS CoV-2 IgG (S; rel. opt. denzita [-] IA)
IgA:
50355 Anti-SARS CoV-2 IgA (B; arb. konc. [arb.j.] *)
50356 Anti-SARS CoV-2 IgA (B; arb. konc. [arb.j.] ICHR)
50357 Anti-SARS CoV-2 IgA (P; arb. konc. [arb.j.] *)
50358 Anti-SARS CoV-2 IgA (P; arb. konc. [arb.j.] IA)
50359 Anti-SARS CoV-2 IgA (P; arb. konc. [arb.j.] ICHR)
50360 Anti-SARS CoV-2 IgA (S; arb. konc. [arb.j.] *)
50361 Anti-SARS CoV-2 IgA (S; arb. konc. [arb.j.] IA)
50362 Anti-SARS CoV-2 IgA (S; arb. konc. [arb.j.] ICHR)
50580
Anti-SARS CoV-2 IgA (P; rel. opt. denzita [-] *)
50581
Anti-SARS CoV-2 IgA (P; rel. opt. denzita [-] IA)
50582
Anti-SARS CoV-2 IgA (S; rel. opt. denzita [-] *)
50583
Anti-SARS CoV-2 IgA (S; rel. opt. denzita [-] IA)
IgA+IgM:
50377 Anti-SARS CoV-2 IgA+IgM (P; arb. konc. [arb.j.] *)
50378 Anti-SARS CoV-2 IgA+IgM (P; arb. konc. [arb.j.] IA)
50379 Anti-SARS CoV-2 IgA+IgM (S; arb. konc. [arb.j.] *)
50380 Anti-SARS CoV-2 IgA+IgM (S; arb. konc. [arb.j.] IA)
Je-li výsledek
pozitivní, znamená to, že pozitivní je IgA, nebo IgM, nebo IgA i IgM.
IgM+IgG (rychlotest - IgM nebo IgG):
50381 Anti-SARS CoV-2 IgM+IgG (B; arb. konc. [arb.j.] ICHR)
50382 Anti-SARS CoV-2 IgM+IgG (P; arb. konc. [arb.j.] ICHR)
50383 Anti-SARS CoV-2 IgM+IgG (S; arb. konc. [arb.j.] ICHR)
Položky pro
proceduru * nejsou u IgM+IgG záměrně založené.
Je-li výsledek
pozitivní, znamená to, že pozitivní je IgM, nebo IgG, nebo IgM i IgG.
Poznámky k vyšetření protilátek:
Položky pro
vyšetření protilátek jsou připravené obecně - jak pro průkaz přítomnosti, tak i
pro následné kvalitativní vyšetření. Jsou svázané s MTV = KVAL.
Stanovení
procedurou IA (například CLIA, ELISA aj.), nebo ICHR (rychlotest) jsou
kvalitativně velmi odlišná, nutno rozlišovat! Stanovení s procedurou * je
předpřipraveno především pro případ nových jiných vyšetření, která se objeví
v období mezi upgrade NČLP. Položky s procedurou * používejte jen
výjimečně!
K proceduře IA lze sdělovat upřesnění
(specifikaci - např. CLIA,
ELISA aj.), zasílá se v datovém bloku DASTA ku_z_lab v atributu spec_proc.
Jakmile budou
k dispozici testy kvantitativní, budou založeny nové sady položek
s druhem veličiny ARBSC.
Jednotky AU/ml
nejsou v NČLP zavedené, výsledky se sdělují pouze jako formalizované texty
prostřednictvím položek s druhem veličiny ARBC (arb. konc.) v
[arb.j.].
D: „Informatické položky
pro potřeby sdělování vyšetření SARS CoV-2“
Zavedeno
v březnu 2020 pro dočasné používání po dobu pandemie COVID-19.
20897
SARS CoV-2 - zpráva k vyšetření (Blok interpretační, sdělení; TYPE [-] Datový
přenos)
Prostor pro vkládání dalších informací k vyšetřením SARS
CoV-2 dle pokynů ÚZIS.
Připojuje se k hlášení ÚZIS aj.
Pomocná položka pro potřeby mimořádných epidemiologických
opatření.
20898
SARS CoV-2 - specifikace procedury (Blok interpretační, sdělení; TYPE [-]
Datový přenos)
Prostor pro vkládání doplňujících informací k vyšetřením
SARS CoV-2, které IS odesílatele nesděluje formalizovaně.
Patří sem především podrobnější specifikace procedury
(dle pokynů ÚZIS). Dočasně také specifikace systému a subsystému případně
odběru, pokud toto neumí IS odesílatele sdělovat prostřednictvím DS 4.20.01 a
výše.
Krátký text. Položka dočasného významu.
Například:
RT-PCR pro jeden
gen
pankoronavirová
RT-PCR
a další dle pokynů
ÚZIS
Aktualizováno 17.12.2020