Přehled
současných vyšetření SARS-CoV-2 v NČLP (k 1. 4.
2021):
Žlutě
podbarvené klíče položek jsou novinky zavedené k 1. 12. 2020 (prosincový
upgrade NČLP).
Zeleně
podbarvené klíče položek jsou novinky zavedené k 17. 12. 2020 (prosincový
upgrade NČLP).
Azurově
podbarvené klíče položek jsou novinky zavedené k 25. 1. 2021 (mimořádný
upgrade NČLP).
Purpurově
podbarvené klíče položek jsou novinky zavedené k 17. 2. 2021 (mimořádný
upgrade NČLP).
Červeně
podbarvené klíče položek jsou novinky zavedené k 1. 3. 2021 (mimořádný
upgrade NČLP).
Šedivě
podbarvené klíče položek jsou novinky zavedené k 15. 3. 2021 (mimořádný
upgrade NČLP).
Modře podbarvené klíče položek jsou novinky zavedené k 1. 4. 2021 (řádný
dubnový upgrade NČLP).
Černě podbarvené klíče položek jsou novinky zavedené k 1. 5. 2021 (řádný
dubnový upgrade NČLP).
V následujících
seznamech uvádíme všechny založené položky pro vyšetření týkající se SAS-CoV-2.
Připomínáme, že
položky s procedurou * slouží především k realizaci vazeb na
mezinárodní položky NPU,
v tuzemské
praxi používejte především položky s konkrétní procedurou.
A1.
„PCR vyšetření“ (detekce RNA)
19934 RNA viru SARS-CoV-2 (SPCORL; přítomnost
[-] *)
19935 RNA viru SARS-CoV-2 (SPCORL; přítomnost
[-] PCR)
50701 RNA viru SARS-CoV-2 (SPCORL; přítomnost [-] LAMP)
50702 RNA viru SARS-CoV-2 (SPCORL; přítomnost [-] PCRM)
19936 RNA viru SARS-CoV-2 (SPCRESP; přítomnost
[-] *)
19937 RNA viru SARS-CoV-2 (SPCRESP; přítomnost
[-] PCR)
50703 RNA viru SARS-CoV-2 (SPCRESP; přítomnost [-] PCRM)
50375 RNA viru SARS-CoV-2 (CSF; přítomnost [-]
*)
50376 RNA viru SARS-CoV-2 (CSF; přítomnost [-]
PCR)
50698 RNA viru SARS-CoV-2 (SAL; přítomnost [-] *)
50700 RNA viru SARS-CoV-2 (SAL; přítomnost [-] PCR)
50699 RNA viru SARS-CoV-2 (SAL; přítomnost [-] LAMP)
Položky pro průkaz přítomnosti pracují
s maticí MTV = KVAL - podrobněji v část „E“.
Položky pro průkaz mutací
/ delecí a pro sdělení varianty
viru - viz popis níže v části „D“.
A2.
„PCRQ vyšetření“ (detekce RNA - kvantitativně)
50704 RNA viru
SARS-CoV-2 (P; arb. látková konc. [kU/l] *)
50705 RNA viru SARS-CoV-2
(P; arb. látková konc. [kU/l] PCRQ)
Upozornění:
Pro mikrobiologická vyšetření ze systémů SPCORL,
SPCRESP a CSF se uvádí upřesnění systému - tzv. „specifikace“ (viz DASTA,
datový blok ku_z_lab, atributy: syst_sp_klic a syst_sp_text a případně subsp_text).
Pro SPCORL
(horní cesty dýchací) to jsou specifikace: LANTH, LASIN, PUMEAR, PUSIN, SWEAR,
SWGIN, SWLAR (výtěr z laryngu),
SWMEAR, SWMOU, SWNAS (výtěr
z nosu), SWNTH (výtěr
z nosohltanu), SWTHR (výtěr
z hrdla), SWTON (výtěr z tonsil), GARF (tekutina
získaná kloktáním hltanu a dutiny ústní).
Pro SPCRESP
(dolní cesty dýchací) jsou secifikace: ASBRO, ASTRA, BRBRC, ENDOTRAC, EXSOPNT (sputum vykašlané), EXINDUK (sputum indukované), LABRAL,
LABRALC, LABRO, LUNG(BI), PLF.
Pro CSF
(likvor) jsou specifikace: KOMORY, PATKANAL.
Pro SAL (sliny) nejsou
žádné další specifikace (systém je samostatný, není součástí SPCORL).
Položky s procedurou * jsou pouze pro výjimečné
situace, kdy nelze proceduru zjistit, používejte výjimečně! (Jsou připravené
pro předávání informací ze zahraničních informačních systémů.)
Poznámky:
Pro vyšetření z běžných výtěrů pro vyšetření RNA
viru SARS-CoV-2 slouží položka 19935.
Pokud IS dosud neumí pracovat se specifikacemi
mikrobiologických systémů, lze ji při sdělování (zejména do ÚZIS) provizorně
dočasně uvádět volným textem do položky 20898 - viz níže v části „F“.
Procedura LAMP
je nově zavedena od prosincového upgrade 2020.
Procedura PCRQ
je nově zavedena od prosincového upgrade 2020 pro kvantitativní stanovení.
Procedura PCRM je zavedena jen
výjimečně pro vyšetření SARS-CoV-2 na základě požadavků ÚZIS.
Běžně se PCRM
v NČLP nerozlišuje, pracuje se pouze s PCR. Zavedeno pouze pro SARS-CoV-2.
B.
„antigen“ (detekce antigenu)
19930 Antigen viru SARS-CoV-2 (P; přítomnost
[-]*)
50371 Antigen viru SARS-CoV-2 (P; přítomnost [-]IA)
19931 Antigen viru SARS-CoV-2 (P; přítomnost [-]ICHR)
19932 Antigen viru SARS-CoV-2 (S; přítomnost [-]*)
50372 Antigen viru SARS-CoV-2 (S; přítomnost [-]IA)
19933 Antigen viru SARS-CoV-2 (S; přítomnost [-]ICHR)
51336 Antigen-N viru SARS-CoV-2 (S; hmot. konc. [ng/l] *)
51337 Antigen-N viru SARS-CoV-2 (S; hmot. konc. [ng/l] IA)
50373 Antigen viru SARS-CoV-2 (SPCORL; přítomnost [-]*)
50779
Antigen viru SARS-CoV-2 (SPCORL; přítomnost [-]IA)
50374 Antigen viru SARS-CoV-2 (SPCORL; přítomnost [-]ICHR) - rychlotest z výtěru z oblasti
„ORL“
50696 Antigen viru
SARS-CoV-2 (SAL; přítomnost [-]*)
50778
Antigen viru SARS-CoV-2 (SAL; přítomnost [-] IA)
50697 Antigen viru
SARS-CoV-2 (SAL; přítomnost [-]ICHR) -
rychlotest ze slin
51340 Antigen
viru SARS-CoV-2 (Stolice; přítomnost [-] *)
51341 Antigen
viru SARS-CoV-2 (Stolice; přítomnost [-] IA)
51342 Antigen
viru SARS-CoV-2 (Stolice; přítomnost [-] Imunochromatografie)
Položky pro průkaz přítomnosti pracují
s maticí MTV = KVAL - podrobněji v část „E“.
Upozornění:
Pro mikrobiologická vyšetření ze systému SPCORL se
uvádí upřesnění systému - tzv. „specifikace“ (viz DASTA, datový blok ku_z_lab, atributy: syst_sp_klic a syst_sp_text
a případně subsp_text).
Pro SPCORL
(horní cesty dýchací) to jsou specifikace: LANTH, LASIN, PUMEAR, PUSIN, SWEAR,
SWGIN, SWLAR (výtěr z laryngu), SWMEAR, SWMOU, SWNAS (výtěr z nosu),
SWNTH (výtěr z nosohltanu), SWTHR (výtěr z hrdla), SWTON (výtěr
z tonsil), GARF (tekutina získaná kloktáním
hltanu a dutiny ústní).
Pro SAL (sliny) nejsou
žádné další specifikace (systém je samostatný, není součástí SPCORL).
Stanovení procedurou IA (například CLIA, ELISA aj.), nebo ICHR
(rychlotest) jsou kvalitativně velmi odlišná, nutno rozlišovat! Stanovení
s procedurou * je předpřipraveno především pro případ nových jiných
vyšetření, která se objeví v mezidobí mezi upgrade NČLP. Položky s
procedurou * používejte jen výjimečně!
K proceduře IA
lze sdělovat upřesnění (specifikaci - např. CLIA, ELISA aj.), zasílá se v datovém bloku
DASTA ku_z_lab v atributu spec_proc.
C. „protilátky proti
SARS-CoV-2“
U položek s druhem veličiny ARBC
(arb. konc.) jsou sdělované textové výsledky dle matice MTV = KVAL.
U položek s druhem veličiny RODIP
(relativní optická denzita) jsou
vždy sdělované textové výsledky dle matice MTV = KVAL a současně mohou být zasílané
naměřené hodnoty jako tzv. „index pozitivity“.
U položek s druhem veličiny ARBSC
(arbitrární látková koncentrace) jsou sdělované numerické výsledky
v jednotkách kU/l (kIU/l) společně s referenčními mezemi (škálami). Pro SARS-CoV-2 dosud nejsou.
IgM:
50367 Anti-SARS-CoV-2 IgM (B; arb. konc. [arb.j.] *)
50368 Anti-SARS-CoV-2 IgM (B; arb. konc. [arb.j.] ICHR) - „rapid test“
19924 Anti-SARS-CoV-2 IgM (P; arb. konc. [arb.j.] *)
19940 Anti-SARS-CoV-2 IgM (P; arb. konc. [arb.j.] IA)
50369 Anti-SARS-CoV-2 IgM (P; arb. konc. [arb.j.] ICHR)
19925 Anti-SARS-CoV-2 IgM (S; arb. konc. [arb.j.] *)
19941 Anti-SARS-CoV-2 IgM (S; arb. konc. [arb.j.] IA)
50370 Anti-SARS-CoV-2 IgM (S; arb. konc. [arb.j.] ICHR)
50588
Anti-SARS-CoV-2 IgM (P; rel. opt. denzita [-] *)
50589
Anti-SARS-CoV-2 IgM (P; rel. opt. denzita [-] IA)
50590
Anti-SARS-CoV-2 IgM (S; rel. opt. denzita [-] *)
50591
Anti-SARS-CoV-2 IgM (S; rel. opt. denzita [-] IA)
50826 Anti-SARS-CoV-2 IgM (P; arb. látková konc. [kU/l] *)
50827 Anti-SARS-CoV-2 IgM (P; arb. látková konc. [kU/l] IA)
50828 Anti-SARS-CoV-2 IgM (S; arb. látková konc. [kU/l] *)
50829 Anti-SARS-CoV-2 IgM (S; arb. látková konc. [kU/l] IA)
IgG:
50363 Anti-SARS-CoV-2 IgG (B; arb. konc. [arb.j.] *)
50364 Anti-SARS-CoV-2 IgG (B; arb. konc. [arb.j.] ICHR) - „rapid test“
19922 Anti-SARS-CoV-2 IgG (P; arb. konc. [arb.j.] *)
19938 Anti-SARS-CoV-2 IgG (P; arb. konc. [arb.j.] IA)
50365 Anti-SARS-CoV-2 IgG (P; arb. konc. [arb.j.] ICHR)
19923 Anti-SARS-CoV-2 IgG (S; arb. konc. [arb.j.] *)
19939 Anti-SARS-CoV-2 IgG (S; arb. konc. [arb.j.] IA)
50366 Anti-SARS-CoV-2 IgG (S; arb. konc. [arb.j.] ICHR)
50584
Anti-SARS-CoV-2 IgG (P; rel. opt. denzita [-] *)
50585
Anti-SARS-CoV-2 IgG (P; rel. opt. denzita [-] IA)
50586 Anti-SARS-CoV-2
IgG (S; rel. opt. denzita [-] *)
50587
Anti-SARS-CoV-2 IgG (S; rel. opt. denzita [-] IA)
50822 Anti-SARS-CoV-2 IgG (P; arb. látková konc. [kU/l] *)
50823 Anti-SARS-CoV-2 IgG (P; arb. látková konc. [kU/l] IA)
50824 Anti-SARS-CoV-2 IgG (S; arb. látková konc. [kU/l] *)
50825 Anti-SARS-CoV-2 IgG (S; arb. látková konc. [kU/l] IA)
51323 Anti-N-antigen SARS-CoV-2 IgG (P; arb. konc. [arb.j.]
*)
51324 Anti-N-antigen
SARS-CoV-2 IgG (P; arb. konc. [arb.j.] IA)
51325 Anti-N-antigen
SARS-CoV-2 IgG (S; arb. konc. [arb.j.] *)
51326 Anti-N-antigen
SARS-CoV-2 IgG (S; arb. konc. [arb.j.] IA)
51327 Anti-S-antigen
SARS-CoV-2 IgG (P; arb. konc. [arb.j.] *)
51328 Anti-S-antigen
SARS-CoV-2 IgG (P; arb. konc. [arb.j.] IA)
51329 Anti-S-antigen
SARS-CoV-2 IgG (S; arb. konc. [arb.j.] *)
51330 Anti-S-antigen
SARS-CoV-2 IgG (S; arb. konc. [arb.j.] IA)
IgA:
50355 Anti-SARS-CoV-2 IgA (B; arb. konc. [arb.j.] *)
50356 Anti-SARS-CoV-2 IgA (B; arb. konc. [arb.j.] ICHR)
50357 Anti-SARS-CoV-2 IgA (P; arb. konc. [arb.j.] *)
50358 Anti-SARS-CoV-2 IgA (P; arb. konc. [arb.j.] IA)
50359 Anti-SARS-CoV-2 IgA (P; arb. konc. [arb.j.] ICHR)
50360 Anti-SARS-CoV-2 IgA (S; arb. konc. [arb.j.] *)
50361 Anti-SARS-CoV-2 IgA (S; arb. konc. [arb.j.] IA)
50362 Anti-SARS-CoV-2 IgA (S; arb. konc. [arb.j.] ICHR)
50580
Anti-SARS-CoV-2 IgA (P; rel. opt. denzita [-] *)
50581
Anti-SARS-CoV-2 IgA (P; rel. opt. denzita [-] IA)
50582
Anti-SARS-CoV-2 IgA (S; rel. opt. denzita [-] *)
50583
Anti-SARS-CoV-2 IgA (S; rel. opt. denzita [-] IA)
50818 Anti-SARS-CoV-2 IgA (P; arb. látková konc. [kU/l] *)
50819 Anti-SARS-CoV-2 IgA (P; arb. látková konc. [kU/l] IA)
50820 Anti-SARS-CoV-2 IgA (S; arb. látková konc. [kU/l] *)
50821 Anti-SARS-CoV-2 IgA (S; arb. látková konc. [kU/l] IA)
Bez rozlišení tříd:
51315 Anti-SARS-CoV-2 (P; arb. konc. [arb.j.] *)
51316 Anti-SARS-CoV-2 (P; arb. konc. [arb.j.] IA)
51317 Anti-SARS-CoV-2 (S; arb. konc. [arb.j.] *)
51318 Anti-SARS-CoV-2 (S; arb. konc. [arb.j.] IA)
IgA+IgG:
51319 Anti-SARS-CoV-2 IgG+IgA (P; arb. konc. [arb.j.] *)
51320 Anti-SARS-CoV-2
IgG+IgA (P; arb. konc. [arb.j.] IA)
51321 Anti-SARS-CoV-2
IgG+IgA (S; arb. konc. [arb.j.] *)
51322 Anti-SARS-CoV-2
IgG+IgA (S; arb. konc. [arb.j.] IA)
Je-li výsledek
pozitivní, znamená to, že pozitivní je IgA, nebo IgG, nebo IgA i IgG.
IgA+IgM:
50377 Anti-SARS-CoV-2 IgA+IgM (P; arb. konc. [arb.j.] *)
50378 Anti-SARS-CoV-2 IgA+IgM (P; arb. konc. [arb.j.] IA)
50379 Anti-SARS-CoV-2 IgA+IgM (S; arb. konc. [arb.j.] *)
50380 Anti-SARS-CoV-2 IgA+IgM (S; arb. konc. [arb.j.] IA)
Je-li výsledek
pozitivní, znamená to, že pozitivní je IgA, nebo IgM, nebo IgA i IgM.
IgM+IgG:
51331 Anti-SARS-CoV-2
IgM+IgG (B; arb. konc. [arb.j.] *)
50381 Anti-SARS-CoV-2 IgM+IgG (B; arb. konc. [arb.j.] ICHR)
51332 Anti-SARS-CoV-2
IgM+IgG (P; arb. konc. [arb.j.] *)
51333 Anti-SARS-CoV-2
IgM+IgG (P; arb. konc. [arb.j.] IA)
50382 Anti-SARS-CoV-2 IgM+IgG (P; arb. konc. [arb.j.] ICHR)
51334 Anti-SARS-CoV-2
IgM+IgG (S; arb. konc. [arb.j.] *)
51335 Anti-SARS-CoV-2
IgM+IgG (S; arb. konc. [arb.j.] IA)
50383 Anti-SARS-CoV-2 IgM+IgG (S; arb. konc. [arb.j.] ICHR)
Je-li výsledek
pozitivní, znamená to, že pozitivní je IgM, nebo IgG, nebo IgM i IgG.
Poznámky k vyšetření protilátek:
Položky pro
vyšetření protilátek jsou připravené obecně - jak pro průkaz přítomnosti, tak i
pro následné kvalitativní vyšetření. Jsou svázané s MTV = KVAL. Viz též
v části „E“.
Stanovení
procedurou IA (například CLIA, ECLIA, ELISA aj.), nebo ICHR (rychlotest) jsou
kvalitativně velmi odlišná, nutno rozlišovat! Stanovení s procedurou * je
předpřipraveno především pro případ nových jiných vyšetření, která se objeví
v období mezi upgrade NČLP. Položky s procedurou * používejte jen
výjimečně!
Položky
s procedurou * jsou významné především s ohledem na vazby na kódy
NPU.
K proceduře IA lze sdělovat upřesnění
(specifikaci - např. CLIA,
ECLIA,
ELISA aj.), zasílá se v datovém bloku DASTA ku_z_lab v atributu spec_proc.
Jakmile budou
k dispozici testy kvantitativní, budou založeny nové sady položek
s druhem veličiny ARBSC.
Jednotky AU/ml
nejsou v NČLP zavedené, výsledky se sdělují pouze jako formalizované texty
prostřednictvím položek s druhem veličiny ARBC (arb. konc.) v
[arb.j.].
D.
„mutace/delece a varianty SARS-CoV-2“
Původně provizorně založené položky 50780 a
50781 byly nahrazené položkami pro průkaz mutací a delecí a položkami pro
určení varianty sekvenačně i nesekvenačně.
K 1. 3. 2021 byly tyto původní provizorní položky označené jako
obsoletní,
od 1. 4. 2021 jsou neaktuální - nepoužívat:
50780
RNA viru SARS-CoV-2 - genotyp (RNA; seq. var. [-] *)
50781
RNA viru SARS-CoV-2 - genotyp (RNA; seq. var. [-] PCR)
Průkaz mutací / delecí:
50784 RNA viru SARS-CoV-2 - A570D (RNA; přítomnost [-] *)
50785 RNA viru SARS-CoV-2 - A570D (RNA; přítomnost [-] PCR)
50786 RNA viru SARS-CoV-2 - D614G (RNA; přítomnost [-] *)
50787 RNA viru SARS-CoV-2 - D614G (RNA; přítomnost [-] PCR)
50788 RNA viru SARS-CoV-2 - Del69-70 (RNA; přítomnost [-] *)
50789 RNA viru SARS-CoV-2 - Del69-70 (RNA; přítomnost [-] PCR)
50790 RNA viru SARS-CoV-2 - E484K (RNA; přítomnost [-] *)
50791 RNA viru SARS-CoV-2 - E484K (RNA; přítomnost [-] PCR)
50792 RNA viru SARS-CoV-2 - K417N (RNA; přítomnost [-] *)
50793 RNA viru SARS-CoV-2 - K417N (RNA; přítomnost [-] PCR)
50794 RNA viru SARS-CoV-2 - N439K (RNA; přítomnost [-] *)
50795 RNA viru SARS-CoV-2 - N439K (RNA; přítomnost [-] PCR)
50796 RNA viru SARS-CoV-2 - N501Y (RNA; přítomnost [-] *)
50797 RNA viru SARS-CoV-2 - N501Y (RNA; přítomnost [-] PCR)
50798 RNA viru SARS-CoV-2 - P681H (RNA; přítomnost [-] *)
50799 RNA viru SARS-CoV-2 - P681H (RNA; přítomnost [-] PCR)
50800 RNA viru SARS-CoV-2 - T716I (RNA; přítomnost [-] *)
50801 RNA viru SARS-CoV-2 - T716I (RNA; přítomnost [-] PCR)
50806
RNA viru SARS-CoV-2 - A701V (RNA; přítomnost [-] *)
50807
RNA viru SARS-CoV-2 - A701V (RNA; přítomnost [-] PCR)
50808
RNA viru SARS-CoV-2 - Del144 (RNA; přítomnost [-] *)
50809
RNA viru SARS-CoV-2 - Del144 (RNA; přítomnost [-] PCR)
50810
RNA viru SARS-CoV-2 - K417T (RNA; přítomnost [-] *)
50811
RNA viru SARS-CoV-2 - K417T (RNA; přítomnost [-] PCR)
50812
RNA viru SARS-CoV-2 - L452R (RNA; přítomnost [-] *)
50813
RNA viru SARS-CoV-2 - L452R (RNA; přítomnost [-] PCR)
50814 RNA
viru SARS-CoV-2 - N501T (RNA; přítomnost [-] *)
50815
RNA viru SARS-CoV-2 - N501T (RNA; přítomnost [-] PCR)
50838 RNA viru SARS-CoV-2 - F888L (RNA; přítomnost [-] *)
50839 RNA viru SARS-CoV-2 - F888L (RNA; přítomnost [-] PCR)
50836 RNA viru SARS-CoV-2 - V1176F (RNA; přítomnost [-] *)
50837 RNA viru SARS-CoV-2 - V1176F (RNA; přítomnost [-] PCR)
50906 RNA viru SARS-CoV-2 - Del141-143 (RNA; přítomnost [-]
*)
50907 RNA
viru SARS-CoV-2 - Del141-143 (RNA; přítomnost [-] PCR)
51338 RNA viru
SARS-CoV-2 - E484Q (RNA; přítomnost [-] *)
51339 RNA viru
SARS-CoV-2 - E484Q (RNA; přítomnost [-] PCR)
Položky pro průkaz přítomnosti pracují
s maticí MTV = KVAL - podrobněji v část „E“.
Interpretace vyšetření mutací a delecí - určení
varianty (tj. pro nesekvenačních
vyšetření):
50782 RNA viru SARS-CoV-2 - varianta (RNA; vlastnost/popis [-] *)
50783 RNA viru SARS-CoV-2 - varianta (RNA; vlastnost/popis [-] PCR) -
formalizovaně (ÚZIS)
50816
RNA viru SARS-CoV-2 - varianta - poznámka (RNA; vlastnost/popis [-] *)
50817
RNA viru SARS-CoV-2 - varianta - poznámka (RNA; vlastnost/popis [-] PCR) -
volným textem
50909 RNA viru SARS-CoV-2 - vlastnost - popis (RNA;
vlastnost/popis [-] *)
50910 RNA viru SARS-CoV-2 - vlastnost - popis (RNA;
vlastnost/popis [-] PCR) - vlastnosti, volný text
Sekvenační vyšetření - určení varianty:
50804
RNA viru SARS-CoV-2 - varianta (sekvenace) (RNA; vlastnost/popis [-] *)
50805
RNA viru SARS-CoV-2 - varianta (sekvenace) (RNA; vlastnost/popis [-] SEQ) -
formalizovaně (ÚZIS)
50802
RNA viru SARS-CoV-2 - varianta "pango" (RNA; seq. var. [-] *)
50803
RNA viru SARS-CoV-2 - varianta "pango" (RNA; seq. var. [-] SEQ) -
neformalizovaně dle „pango“
50909 RNA viru SARS-CoV-2 - vlastnost - popis (RNA;
vlastnost/popis [-] *)
50910 RNA viru SARS-CoV-2 - vlastnost - popis (RNA;
vlastnost/popis [-] PCR) - vlastnosti, volný text
Viz též
matice MTV = GTYPCOV (k položce 50805):
https://www.dastacr.cz/dasta/hypertext/_MTV2_GTYPCOV.htm
Podrobnější informace k položkám pro průkaz
mutací nebo delecí a pro sdělení varianty:
NČLP - mutace, delece a varianty SARS-CoV-2
Základní
informace k problematice:
NČLP - mutace, delece a varianty - výklad
Aktuální přehled variant mutací viru SARS-CoV-2:
Stav k 20. 4. 2021 - vše zapracováno do položek NČLP a
MTV = GTYPCOV. Zdoj: NRL SZU Praha.
E: „Matice MTV = KVAL“
U položek, kde
je výsledkem formalizovaný text z matice MTV=KVAL, se pracuje
s těmito klíči:
NEGAT
POZIT
HRAMICNI
NEPROKAZ
PROKAZ
NELZE
NEPROVED
K uvedeným
klíčům jsou definované názvy i plné názvy - viz obsah MTV.
Vzhledem
k tomu, že některé LIS používají spíše NEPROKAZ/PROKAZ a jiné NEGAT/POZIT,
jsou přípustné obě možnosti, při zpracovávání dat je nutné ošetřit, že
v tomto případě odpovídá POZIT=PROKAZ a NEGAT=NEPROKAZ.
Klíče jsou
sdělované povinně, textové vyjádření pro nález bývá přebíráno z národní
nebo lokální části MTV.
V případě
průkazu mutací / delecí je nutné uvádět všechna vyšetření mutací /delecí
z příslušného pacientova vzorku, včetně těch, která patří do spektra, ale
nebyla provedena (NEPROVED).
F: „Informatické položky
pro potřeby sdělování vyšetření SARS-CoV-2“
Zavedeno
v březnu 2020 pro dočasné používání po dobu pandemie COVID-19.
20897 SARS-CoV-2 -
zpráva k vyšetření (Blok interpretační, sdělení; TYPE [-] Datový přenos)
Prostor pro vkládání dalších informací k vyšetřením
SARS-CoV-2 dle pokynů ÚZIS.
Připojuje se k hlášení ÚZIS aj.
Pomocná položka pro potřeby mimořádných epidemiologických
opatření. Její obsah si určuje ÚZIS.
20898 SARS-CoV-2 -
specifikace procedury (Blok interpretační, sdělení; TYPE [-] Datový přenos)
Prostor pro vkládání doplňujících informací k vyšetřením
SARS-CoV-2, které IS odesílatele nesděluje formalizovaně.
Patří sem především podrobnější specifikace procedury
(dle pokynů ÚZIS). Dočasně také specifikace systému a subsystému případně
odběru, pokud toto neumí IS odesílatele sdělovat prostřednictvím DS 4.20.01 a
výše.
Krátký text. Položka dočasného významu. Její obsah si
určuje ÚZIS.
Například:
RT-PCR pro jeden
gen
pankoronavirová
RT-PCR
a další dle pokynů
ÚZIS
Aktualizováno 20.4.2021