Mapování laboratorního číselníku na NČLP z hlediska laboratoře

Pokud nejste dosud seznámeni se základními pojmy - viz: NČLP - základní informace, popis a teorie.

Přístup k problematice bude jiný pro začínající pracoviště, jiný pro pracoviště pokročilé a již zkušené.

Pokyny se budou lišit s ohledem na LIS nebo jiný nástroj, s jehož pomocí bude mapování realizováno.

Pro úvodní výklad a vysvětlení principů práce zvolíme obecný přístup s pomocí volně přístupných nástrojů.

Pro seznámení a práci s NČLP jsou k dispozici obecné volně přístupné nástroje:

NČLP v hypertextové podobě na stránkách DASTACR v nabídce „NČLP“:

https://dastacr.cz/dasta/hypertext/DSBFV.htm

Podrobněji viz:

NČLP - práce s hypertextovou formou číselníku

Program ČLP, v němž lze položky číselníku různě filtrovat a třídit a vyznačovat si ty, které jsou předmětem zájmu - je ke stažení prostřednictvím odkazu na titulní stránce webu DASTACR:

https://dastacr.cz/ (instalace je možná pouze na počítače s OS Windows)

Podrobněji viz:

NČLP - práce s programem ČLP

Měl by být k dispozici nově připravovaný nástroj na Národním terminologickém serveru MZ, zatím není funkční - sdělíme více po jeho dokončení a otestování.

Mapování laboratorního číselníku na NČLP - úvodní informace:

Korektní namapování laboratorního číselníku na NČLP je klíčové pro standardní obousměrnou komunikaci laboratoře s objednateli. Pro tuto činnost musí být v laboratoři určen konkrétní pracovník, vybavený patřičnými pravomocemi i potřebnými znalostmi. Nejedná se pouze o jednorázovou činnost, ale o trvalou údržbu s průběžnými kontrolami i úpravami, které budou vyplývat z aktualizací a dalšího vývoje NČLP.

Mapování laboratorního číselníku na NČLP - základní principy:

Pro obousměrnou standardní komunikaci mezi LIS a ostatními IS (ať už cestou DASTA či FHIR) je stěžejní komplexní korektní provázání (namapování) položek laboratorního číselníku na aktuální platné položky NČLP aktuální verze.

Ve finální podobě musí být ke každé položce laboratorního číselníku přiřazena jedna odpovídající položka NČLP, s výjimku položek interních, které nejsou vydávané mimo laboratoř a nemusí být namapované.

Za korektní provázání lze považovat takové, kde vzájemně koresponduje čtveřice:

systém, komponenta, druh veličiny a procedura.

Pokud se jedná o položku numerickou a pokud je v rámci totožného druhu veličiny zavedena v laboratorním číselníku jiná jednotka, než je v NČLP, musí být vytvořen a k mapované položce připojen odpovídající přepočítací faktor prepfak (v DS4 prepocet).

Přepočet:

jednotka_NČLP = prepfak * jednotka_LČLP

Je-li sdělována hodnota v jednotkách dle NČLP a hodnota_lok v jednotkách lokálních, musí platit:

hodnota = prepfak * hodnota_lok

Mapování položek laboratorního číselníku je realizováno vždy na NČLP položku s konkrétní procedurou, jen výjimečně na položku se zástupnou procedurou *.

Pokud není v NČLP položka s potřebnou procedurou k dispozici, je nutné požádat o doplnění varianty s postrádanou procedurou.

Připomínáme zvláštní zacházení s „obálkovými“ procedurami, ke kterým existují specifikace procedury (např. typu immunoassay), kde se v NČLP pracuje se zástupnou procedurou (např. IA). Zástupných procedur bude časem více.

Pokud není v NČLP k dispozici položka s potřebným systémem, může to mít své důvody, nebo nebyla dosud požadovaná a proto je potřeba zažádat o její doplnění.

Kupříkladu u vyšetření krevních plynů se rozlišuje krev arteriální, venózní atd. ale pro běžná vyšetření není takto podrobné rozlišování smysluplné, není ani zavedené.

Pokud není v NČLP k dispozici položka s potřebným druhem veličiny, má to většinou své důvody, nebo nebyla dosud požadovaná a proto je potřeba zažádat o její doplnění (bude-li to přípustné).

V NČLP je dodržováno pravidlo vyplývající z nomenklatury IUPAC/IFCC - tam, kde se pracuje s jasně danou molekulou, pracuje se s druhem veličiny SUBSTC a jednotkami mol/l (včetně prefixů), u proteinů s druhem veličiny MASSC a s g/l (včetně prefixů). Výjimky jsou u hladin léků, kde se pracuje většinou s MASSC. U clearancí jsou zavedené jednotky ml/sec i ml/min. U několika položek NČLP je záměrně více variant.

Pokud není v NČLP k dispozici položka s potřebnou komponentou (tj. analytem, entitou aj.) a byla marně hledána i s využitím synonym a jiných názvů, je potřeba požádat o její doplnění a realizaci položek pro požadované systémy a procedury (a případně i druh veličiny s jednotkou, nejsou-li předpokládatelné).

Upozornění:

Mapování lze realizovat pouze na aktuální položky NČLP.

Mapování na položky NČLP neaktuální či obsoletní je možné jen s ohledem na práci s archivními daty.

Při mapování se nezohledňují specifikace procedur ani specifikace systémů, ty řeší datový standard (v DS4 v ku_z_lab atributy syst_sp_klic a spec_proc). Podobně se neřeší specifikace jednotky u kU/l (v DS4 v bloku vrn element jednotka) či specifikace zařízení - analyzátoru (v DS4 v ku_z_lab atribut device_kod).

Mapování laboratorního číselníku na NČLP s ohledem na příchozí objednávky:

Vedle stěžejního namapování laboratorního číselníku na NČLP, které je důležité (mimo jiné) pro vydávání výsledků, musí být také realizovány vazby s ohledem na objednávky od objednatelů, kteří neznají paletu konkrétní laboratoře a pracují většinou se zástupnými položkami NČLP s blíže neurčenou procedurou, nebo se skupinovými objednávkami.

Teoreticky lze výše zmíněnou problematiku popsat následovně.

Každou položku NČLP si zařadí laboratoř do jedné z pěti skupin:

1. neřešíme

2. pouze přijímáme a umíme či můžeme použít

3. řešíme jako jinou položku NČLP (uvede se odkaz ve formě příslušného klíče NČLP)

4. řešíme předáním do smluvní laboratoře

5. zpracováváme (bez ohledu na to, zda statimově, rutinně, nebo jen ve vybrané dny)

Ad 1:

Tyto položky NČLP nejsou v paletě nabídky laboratoře, nic se u nich nenastavuje, ignorují se.

Ad 2:

Sem patří položky pro zasílání informací o pacientovi, odběru či vzorku.

Takto si laboratoř může označit položky, které umí přijmout a zpracovat.

Ad 3:

Uvede se klíč odpovídající položky NČLP.

Takto budou ošetřeny všechny zástupné položky (s procedurou *), které laboratoř zpracovává coby položky s konkrétní procedurou. Čili bude zde uvedeno přesměrování na vhodnou položku s konkrétní procedurou patřící do laboratorní palety.

Takto budou také ošetřeny položky s jinou procedurou, které lze přesměrovat na vhodnou položku s konkrétní procedurou patřící do laboratorní palety. To může automaticky zajistit i vybavený LIS.

Takto lze také případně provést vzájemné přesměrování objednávek typu sérum (S) a plazma (P).

Ad 4:

Z hlediska objednatele se jedná takřka o totéž, jako skupina 3.

Z hlediska laboratoře se jedná o jinou sérii nutných úkonů (předání požadavků smluvní laboratoři a řešení jejich následné převzetí, zpracování a odeslání).

Ad. 5:

Do této skupiny patří položky, které jsou součástí palety laboratoře - laboratoř je zpracovává i vydává a má je pospané ve své „Laboratorní příručce“.

Je zřejmé, že pro tuto činnost nezvolíme napoprvé práci s komletním NČLP, ale položky si vyfiltrujeme nebo setřídíme např. podle gesce a budeme pracovat se zvolenou podmnožinou. Lze filtrovat i volit podle jiných potřebných vhodných atributů.

Mapování laboratorního číselníku na NČLP - podrobnější informace:

V NČLP jsou položky rozdělené do několika skupin podle toho, jak vznikají, nebo jak se nimi zachází. Ke každé položce NČLP je přiřazen jeden konkrétní typ označovaný jako VZNIK.

Podrobnější informace k typu VZNIK:

NČLP - typy položek z hlediska vzniku, popis

M - položky měřené, pozorované, odvozené v laboratoři

Stěžejní a nejrozsáhlejší typ položek zahrnující takřka všechny gesce, Jsou zde nejvíce zastoupené položky, jejichž výsledkem je numerické hodnota, dále položky s formalizovanými textovými výsledky dle matic MTV a položky s výsledkem ve tvaru volného textu. Problematika mapování je popsána výše v části „Mapování laboratorního číselníku na NČLP - základní principy“.

Položky toho typu slouží k realizaci objednávky objednatelem i ke sdělování naměřených hodnot - výsledků.

Pro objednávání jsou nejčastěji využívané položky se zástupnou procedurou (*), k vydávání odpovídající položky s konkrétní procedurou. K vydávaným numerickým položkám jsou připojované referenční meze nebo škály.

Speciální skupinou jsou položky pro posouzení kvality materiálu pro B, P, S. Jedná se o položky s klíči 52754 - 52773, které patří do kategorie STAVMAT - viz NČLP - sdělování hodnocení kvality materiálu. Tyto položky neslouží k objednávání (byť to není zakázáno), jejich realizaci i vydání rozhoduje laboratoř.

Podrobnější informace k položkám VZNIK = M s ohledem na specifické záležitosti jednotlivých gescí budou k dispozici v dalším upgrade.

V - položky výpočtové (z naměřených hodnot a případně i dalších dodaných údajů)

Rozsáhlý typ položek, které vznikají výpočtem, ať už přímo v analyzátoru nebo v LIS. K výpočtu jsou vždy nutné příslušné naměřené hodnoty a případně i informace a hodnoty dodané laboratoři objednatelem. Některé výpočty si může (z dodaných naměřených hodnot) realizovat i příjemce - objednatel.

V praxi se výpočtové položky neobjednávají, laboratoř je zasílá vždy, když má potřebné podklady - čili naměřené hodnoty a případně i další dodané informace k pacientovi či vzorku. Většinou se tedy objednávají nepřímo - objednáním pro výpočet potřebných měřených hodnot a (je-li to pro výpočet nutné) dodáním potřebných informací. Pro některé objednávky se využívá objednávka skupinová („G“).

Samostatným typem jsou položky pro výpočet odpadů („D“).

D - položky s výpočty odpadů (z naměřených hodnot a dodané informaci o odpadu za čas)

Samostatný typ výpočtových položek, který se týká systémů:

U - DU pro moč … (TU za uvedený čas, MU za minutu, SU za sekundu)

UNSFDR - DUNSFDR pro drén

UNSFS - DUNSFS pro sondu

Pro speciální problematiku jako sledování metabolických bilancí:

SW - DSW pro pot

F - DF pro stolici

DUF - DDUF pro duodenální tekutinu

STF - DSTF pro žaludeční tekutinu

Pro vyšetřování dialyzátu:

PRF(PT) - DPRD(PT) … (FPRD(PT) za uvedený čas

Tyto výpočty realizuje laboratoř vždy, když jsou k dispozici příslušné naměřené hodnoty a informace o objemu za čas. Objednávají se jen vyšetření příslušných žádaných analytů.

Popis algoritmu výpočtu v případě denního odpadu:

DENNÍ ODPAD analytu = KONCENTRACE analytu x OBJEM ZA DEN / 1000;

kde OBJEM ZA DEN je zadáván v mililitrech, koncentrace analytu je na litr, odpad je vyjadřován na litr

K - mikrobiologická kultivační a mikroskopická vyšetření (kromě položek mikroskopických výčtových)

Samostatná problematika, která se týká mikrobiologických kultivačních a mikroskopických vyšetření, řešených prostřednictvím speciálních datových bloků standardu DS4.

V NČLP se jedná o položky s konstrukcí: vyšetřovaný systém_AGENS_požadovaná procedura.

Podrobnější informace: NČLP - mikrobiologická kultivační vyšetření

Poznámky:

V gesci mikrobiologie se také běžně pracuje s výčtovými položkami typu VZNIK = M (průkazy aj.).

Pro FHIR budou k dispozici položky typu VZNIK = A - nyní v jednání a přípravách.

G - skupinové objednávky (formalizované; dle rámcového popisu v NČLP)

Speciální typ položek sloužících k realizaci objednávky více položek typu VZNIK = M (případně i V). Jsou vytvářené pro konkrétní systémy, nebo pro zástupný systém GORD (tam, kde lze systém pružně dourčit z kontextu). Jedná se o položky, které slouží pouze k realizaci skupinové objednávky, nenesou žádné jiné informace, nejsou jako takové vracené s výsledky.

K definici těchto položek NČLP je připojován výčet minimální i doporučené konkrétní podoby objednávky, její konkrétní obsah deklaruje laboratoř ve své „Laboratorní příručce“ nebo jiné vhodné dokumentaci.

Poznámka:

Se skupinovými objednávkami může interně pracovat také informační systém objednatele, v tom případě nezasílá laboratoři skupinové objednávky, ale již konkrétní rozepsané objednávané položky NČLP.

Příklad skupinových objednávek:

S - souhrnná hodnocení, interpretace (k uvedeným problémově zaměřeným oblastem)

Speciální typ položek určených k předávání textových bloků obsahujících interpretace k problémově zaměřeným celkům - skupinám položek, řešících určitou problematiku. Tyto položky neslouží k objednávání, laboratoř je zařazuje dle svých interních pravidel či na základě příslušných standardů či doporučení.

Příklad:

Q - objednávky a vyznačení pro vyšetření typu "sledování v časovém intervalu"

Speciální typ položek pro řešení tzv. funkčních (zátěžových) testů probíhajících v časovém intervalu.

Tento typ je již řadu let součástí NČLP, ale do praxe bude zaveden v následujícím období.

Pro další informace: Sledování v časovém intervalu.

Příklad:

Uvedené typy si laboratoř může v NČLP označit jako položky, které umí přijmout a zpracovat:

L - laboratorní informace o vzorku (patří sem položky: objem, čas sběru, typ odběru, stav materiálu, poznámky - specifikace - jiné) - sdělují se laboratoři

Příklad pro systém U:

Kategorie = ISOBJCAS

03142 Objem (U; objem [ml] DTP)

02994 Čas sběru (U; čas [h] DTP)

Kategorie = ISSTAVM

20303 Stav materiálu (U; TYPE [-] DTP)

Kategorie = ISTYPODB

20396 Typ odběru (U; TYPE [-] DTP)

Kategorie = ISPOZNS

20224 = Poznámky-specifikace-jiné (U; vlastnost/popis [-] DTP)

U - události významné z hlediska interpretace (indikace události a případně čas) - sdělují se laboratoři

Patří sem:

I - formalizované informace o pacientovi pro zpracování či intepretace - sdělují se laboratoři

Patří sem:

P - vybrané informace o pacientovi potřebné pro výpočty (numerické údaje) - sdělují se laboratoři

Patří sem:

Uvedené typy si může laboratoř v NČLP označit jako položky, které umí zpracovat a vydávat:

B - textový blok připojovaný laboratoří k nálezu - zprávě (z rozhodnutí laboratoře)

O - obrazové informace připojované laboratoří k nálezu (plyne z objednávky příslušných vyšetření)

Příklad ad „B“:

Příklad ad „O“:

10.

Poznámka:

Typy vnik = N, Z, H - jsou již obsoletní, v FHIR nebudou.

Pravidelné kontroly mapování laboratorního číselníku na NČLP:

Kontroly mapování by neměly být svazované jen s předen určenými časovými intervaly, měly by být vždy po realizaci upgrade či update číselníku NČLP, neboť vedle nových položek mohou být také některé původní položky již označené jako neaktuální či obsoletní a ty je třeba přesměrovat na jiné vhodnější. Součástí změn mohou být i úpravy názvů položek, na které je vhodné také patřičně zareagovat. Pro tyto činnosti musí být k dispozici vhodné nástroje v LIS.

Kupříkladu po upgrade i update NČLP je nutné prověřit, zda není realizováno mapování na již neaktuální položky NČLP - pokud tomu tak je, je třeba provést přemapování.

V NČLP je vždy uváděn důvod a pokud to je možné, také klíč vhodné nové (náhradní) aktuální položky.

Toto přesměrování lze pak provádět poloautomaticky (pokud to LIS již umožňuje).